Глава 6
Поиск доказательной информации.
Базы данных Цель занятия: сформировать у студента представление об основных принципах поиска и оценки доказательной информации, полученной в результате проведения эпидемиологических исследований.
В результате изучения темы студенты должны знать:
• информационные системы в медицине;
• базы данных: определение, классификация;
• типы и особенности формулировки вопросов, возникающих при оценке эффективности профилактики и лечения;
• электронные источники доказательной информации; содержание и характеристики конкретных БД, содержащих сведения по доказательной медицине;
• поисковые системы в БД; операторы булевой алгебры, используемые при поиске информации;
• стратегии формирования поискового запроса в различных поисковых системах и БД в зависимости от типа клинического вопроса;
• методологические фильтры.
В результате изучения темы студенты должны уметь:
• определять вид и структуру эпидемиологических исследований, позволяющих получить доказательную информацию для решения конкретной практической задачи;
• составлять алгоритм поиска (стратегия поиска) публикаций, посвященных определенному типу эпидемиологических исследований в соответствующих базах данных;
• проводить поиск исследований в базе МЕDLINE с помощью фильтров методологии «Сliniса1 Queries» (клинические запросы);
• оценивать значимость найденной информации для решения практической задачи. САМОПОДГОТОВКА К ЗАНЯТИЮ
В процессе самоподготовки студенты изучают рекомендованную литературу и информационный материал, приведенный в данной главе.
Вопросы для самоподготовки
1. Определение понятия база данных.
1. Типы вопросов, возникающих при решении задач в медицинской практике.
3. Формулировка вопроса. Выделение в вопросе составных частей по формуле Пациент-Вмешательство-Сравнение-Исход (формула — ПВСИ или РІСО).
4. Соответствие часто встречающихся типов практических вопросов в медицине определенным структурам эпидемиологических исследования.
5. Поисковые системы. Применение операторов булевой логики для поиска информации.
6. Источники доказательной информации.
7. Принципы работы с БД МЕDLINE, размещенной на www.pubmed.com. Использование фильтров поиска информации в зависимости от методологии исследования: Сliniса1 Queries (клинические запросы) и Speсiа1 Queries (специальные запросы).
Контроль самоподготовки
Выполните предложенные задания
Задача 1. Найдите в БД МЕDLINE, доступной на сайте www.pubmed.com, следующие статьи, посвященные вопросам эпидемиологических исследований и доказательной медицине.
• Статью С. Л. Плавинского, опубликованную в журнале Nutrition, MetabolismandCardiovascularDiseases, в которой проводилось сравнение уровней общего холестерина плазмы крови и ХС ЛПВП среди жителей Санкт-Петербурга и Лейпцига.
• Серию статей, опубликованных в Журнале американской медицинской ассоциации (JАМА) начиная с 1993г. под названием «Руководства к использованию медицинской литературы».
• Систематический обзор Крейг (Сгаig) с соавторами по оценке методов измерения у детей температуры тела в ушной раковине и в прямой кишке, опубликованный в известном англоязычном журнале примерно в 2000г.
• Серию статей Дэвида Граймза и Кеннета Шулъца, посвященных дизайну эпидемиологических исследований опубликованных в 2002г. в журнале Lancet.
• Найдите максимальное количество статей, написанных профессором Дэвидом Сакеттом,, для которых предложены ссылки к полнотекстовому доступу.
Задача 2. Воспользовавшись фильтрами Сliniса1 Queries, размещенными на сайте www.pubmed.com, найдите не менее трех статей и обзоров (лучше систематических), посвященных следующим аспектам проблемы рака молочной железы:
• этиологическим факторам;
• оценке эффективности лечения;
• диагностике;
• прогнозу. ИНФОРМАЦИОННЫЙ МАТЕРИАЛ
Информационные системы
БД — один из основных компонентов современных информационных систем. Информационная система — взаимосвязанная совокупность средств, методов и персонала, используемых для хранения, обработки и выдачи информации.
Цель любой информационной системы — обработка информации конкретной предметной области. Пример — системы поддержки клинических решений. Обычно они представляют БД, которые объединяют электронные истории болезни со специальными инструментами, такими как автоматические напоминания или калькуляторы дозировки ЛС, предназначенные для использования клиницистами в процессе принятия решений. В основу систем поддержки должны быть положены научно обоснованные руководства по клинической практике или другие достоверные данные научных исследований.
В настоящее время медицинские информационные системы — одна из приоритетных областей разработки программных средств во всем мире и представляют трудоемкую задачу из-за целого ряда факторов:
• множества факторов и сложности их взаимодействия в процессе принятия медицинских решений;
• отсутствия стандартизации в терминологии, формате, шкалах измерения;
• высоких требований к параметрам компьютеров по скоростям доступа, объемам памяти, обработке графики.
Базы данных. БД можно определить как организованную совокупность взаимосвязанных хранимых вместе данных, представленных на электронных носителях, предназначенных и пригодных для решения специальных задач с использованием средств вычислительной техники.
Особенности такой совокупности данных:
• большие объемы информации;
• максимально возможная компактность хранения данных;
• возможность извлечения из БД разнообразной информации в определенной предметной области;
• удобные для пользователя вид и форма извлекаемой информации;
• высокая скорость доступа к данным;
• надежность хранения информации и возможность предоставления санкционированного доступа к данным для отдельных пользователей;
• удобство и простота конструирования пользователем запросов, форм и отчетов для выборки данных.
Создание БД, ее поддержка и обеспечение доступа пользователей к ней осуществляют с помощью специального программного инструмента — системы управления базами данных. Система управления базами данных (СУБД) — программное обеспечение для создания и редактирования баз данных, просмотра и поиска информации в них.
По технологии обработки и хранения данных БД делят на централизованные и распределенные.
Централизованные БД по способу доступа делят на:
• БД с локальным доступом (данные и процедуры их обработки хранятся на одной машине);
• БД с удаленным (сетевым) доступом. Системы управления базами данных с удаленным доступом могут быть построены с использованием архитектур файл-сервер и клиент-сервер.
Архитектура файл-сервер
Принцип организации: одна машина выделена в качестве центральной (сервер файлов), на ней хранится централизованная БД. Остальные машины сети выполняют функции рабочих станций. Файлы БД в соответствии с пользовательскими запросами рабочих станций передаются на эти станции и там обрабатываются. Производительность такой системы падает, если требуется интенсивный одновременный доступ к одним и тем же данным. В настоящее время эту архитектуру считают устаревшей.
Архитектура клиент-сервер
Принцип организации: центральная машина (сервер БД) хранит централизованную БД и процедуры обработки. Клиент посылает запрос, он обрабатывается сервером, и данные, полученные по запросу, передаются клиенту.
Распределенная БД состоит из нескольких частей, хранимых на различных компьютерах вычислительной сети. Этот способ обработки подразумевает наличие нескольких серверов (обслуживающих компьютеров), на которых может храниться пересекающаяся или даже дублирующая информация. Для работы с такой БД используют систему управления распределенными БД.
По используемой модели БД разделяют на иерархические, сетевые реляционные, объектно-ориентированные и гибридные.
Иерархическая модель БД состоит из объектов с указателями от родительских объектов к потомкам, соединяя вместе связанную информацию.
К основным понятиям сетевой модели БД относят: уровень, элемент (узел) и связь. Узел — совокупность атрибутов данных, описывающих некоторый объект. В сетевой структуре каждый элемент бывает связан с любым другим элементом. Сетевые БД подобны иерархическим, за исключением того, что в них имеются указатели в обоих направлениях, которые соединяют родственную информацию.
Реляционная модель БД ориентирована на организацию данных в виде двумерных таблиц. Для этих моделей характерна простота структуры данных, удобное для пользователя табличное представление. В реляционных БД используют язык StructuryQueryLanguage — язык структурированных запросов — универсальный язык, применяемый для создания, модификации и управления данными.
В объектно-ориентированных базах данные хранятся в виде объектов. С объектно-ориентированными базами данных удобно работать, применяя объектно-ориентированное программирование. Однако сегодня такие базы данных еще не достигли такой популярности, как реляционные, поскольку значительно уступают им в производительности.
Гибридные СУБД совмещают в себе возможности реляционных и объектно-ориентированных баз данных.
Сегодня БД — мощный инструмент совершенствования процессов оказания медицинской помощи. Появление в конце XX в. медицинских БД, доступных широкому кругу пользователей, позволило проводить быстрый поиск, анализ и обобщение информации о результатах эпидемиологических и других исследований и способствовало развитию подхода к оказанию медицинской помощи, получившему название «медицина, основанная на доказательствах» (научно-обоснованная медицинская практика). Выбор стратегии поиска информации
Часто встречающиеся типы вопросов в медицинской практике
Из множества вопросов, которые могут интересовать медицинских работников можно выделить наиболее часто встречаемые типы. Это вопросы, касающиеся клинических данных, симптомов заболевания, прогноза, профилактики, этиологии и причин заболевания, вреда и риска, диагностических тестов, дифференциальной диагностики, качества жизни, терапии, экономической эффективности и др.
Для целей разработки стратегий информационного поиска можно указать 5 общих типов клинических вопросов, которые включают в себя все прочие типы.
• Лечение (терапия) — вопросы о том, какое лечение (если таковое возможно) надо назначить и какими могут быть результаты различных методов лечения. Эта группа включает также вопросы относительно профилактики, организации программ скрининга, повышения качества медицинской помощи.
• Диагностика — вопросы относительно степени надежности и клинической полезности конкретного теста, которые обычно ставят, чтобы определить, принесет ли данный тест достаточную пользу конкретному пациенту. В большинстве статей по диагностике результаты исследуемого диагностического теста сравнивают с результатами другого, стандартного теста, который рассматривают как эталонный или авторитетный («золотой стандарт»). Сюда же относят вопросы по дифференциальной диагностике.
• Прогноз — вопросы относительно будущего состояния здоровья пациента, продолжительности и качества его жизни при выборе того или иного конкретного варианта лечения.
• Этиология/побочные эффекты — вопросы относительно взаимосвязей между болезнью и возможными ее причинами, включая побочные эффекты, связанный с различными вариантами лечения (ЛС, терапевтическими и диагностическими вмешательствами).
• Экономическая эффективность — вопросы относительно экономической эффективности различных лечебных, профилактических и диагностических процедур.
Использование технологии доказательной медицины предполагает поиск информации в литературе и БД. Первоочередной шаг научно обоснованной практики (доказательной медицины) — точная формулировка «сфокусированного» вопроса. Формулировка вопроса
В 1995 г. группа ученных во главе с Richardson предложили своеобразную «анатомию» хорошо сформулированного вопроса, которая носит название «формула ПВСИ (РIСО)» и позволяет практикующим медицинским работникам определить четыре компонента правильно сформулированного вопроса.
• Рори1ation(или Раtiепt) — целевой контингент (Популяция или Пациент): кого имеют ввиду?
• Intervention (иногда Ехроsurе) — Вмешательство, (Воздействие): что в отношении пациентов делают или что с ними происходит?
• Сотраrisоп — Сопоставление (Сравнение): какова альтернатива?
• Outcomes — Результаты, (Исходы): как можно измерить результат вмешательства или воздействия?
Таким образом, эти четыре компонента позволяют выбрать дизайн эпидемиологических исследований, результаты которых можно использовать для решения соответствующих практических задач в медицине. Типы вопросов и соответствующий им дизaйн эпидемиологических исследований
• Лечение — систематические обзоры и мета-анализы, рандомизированные контролируемые испытания.
• Диагностика —перекрестные экспериментальные исследования (предпочтительнее сравнение с «золотым стандартом»).
• Прогноз — когортные исследования.
• Этиология/побочные эффекты — когортные исследования, исследования типа «случай—контроль».
• Экономическая эффективность - рандомизированные контролируемые испытания, систематические обзоры, модели анализа принятия решений. Источники доказательной информации
Таблица 6-1 демонстрирует плюсы и минусы доступных источников информации.
Таблица 6-1. Наиболее доступные источники медицинской информации
Источник
| Преимущества
| Недостатки
|
| Книги
| Легкий доступ Глубина охвата Анализ Компактность Можно брать в библиотеке
| Быстро устаревают Дороги Доступ к библиотекам бывает ограничен Требуется много времени для поиска и просмотра
|
| Журналы первичной информации
| Более свежая информация Легкий доступ Компактность
| Не всегда содержат обзоры Дороги Доступ к библиотекам бывает ограничен. Требуется много времени для поиска и просмотра Их слишком много Пристрастность публикаций
|
| Журналы вторичной информации
| Структурированные рефераты Комментарии независимых экспертов Критические оценки доказательств. Методологически надежные исследования Строгие критерии отбора информации Клинически применимые исследования
| Только рефераты Полные тексты исследований отсутствуют
|
| Рефераты статей
| Широкий обзор литературы В целом хорошее качество
| Ограниченная глубина Часто пишут сами авторы
|
| Библиография / списки литературы
| Полезные ссылки на связанную литературу по определенной теме Выделяют статьи высокого качества
| Субъективность авторского выбора Неясные критерии
|
| Источник
| Преимущества
| Недостатки
|
| Коллеги
| Персональная и конкретная
| Пристрастность
|
|
| помощь в соответствии с
| Приоритеты могут отличаться
|
|
| вашими потребностями
| от ваших
|
|
| Помощь легко доступна
| Недостаток времени
|
| WWW
| Самые свежие данные
| Отсутствие центрального
|
|
| Денная / уникальная
| каталога — трудно найти
|
|
| информация
| информацию
|
|
| Профессиональная
| Отсутствие цензуры и
|
|
| организация сети
| редактирования
|
|
| Полные тексты
| Никаких гарантий качества и
|
|
| Доступ к информации со
| достоверности
|
|
| всего мира
| Требуется подключение к
|
|
| Круглосуточный доступ
| Интернету и минимальные
|
|
|
| навыки в области
|
|
|
| информационных технологий
|
| Электронная почта
| Быстрая передача
| С прикрепленными файлами
|
|
| информации
| бывает трудно работать
|
|
| Документы можно
| Спам
|
|
| присоединять к сообщениям
| Угроза заражения вирусами
|
|
| Частные сообщения могут
|
|
|
| быть зашифрованы
|
|
| Списки рассылки
| Связь «один со многими»
| Количество сообщений может
|
|
| Определенная тематика
| быть разным
|
|
| Можно получать только
| Ошибочные сведения
|
|
| еженедельные обзоры
| рассылаются всем
|
|
| Доступен широкий диапазон
| Трудно поддерживать
|
|
| мнений
| обсуждение
|
|
| Очень дешевые средства
|
|
|
| распространения
|
|
|
| Могут быть открыты или
|
|
|
| закрыты для посторонних
|
|
|
| Возможен поиск или
|
|
|
| просмотр архивов
|
|
| Библиографические
| Широкий набор
| Отсутствие полных текстов
|
| БД
| индексируемых журналов
| Отражает пристрастность
|
|
| Регулярное обновление
| публикаций
|
|
| Экономия времени
| Не всегда доступны
|
|
| Удобство пользования
| Иногда неудобны в
|
|
| Свободный текстовый поиск
| использовании
|
|
| Развитые инструменты поиска
| Трудно получать иностранные
|
|
|
| статьи
|
| МEDLINE
| Универсальность доступа Международный охват Индексация на основе предметных рубрик Поиск по типам публикаций Имеются фильтры качества
| Уклон в пользу американских работ Избирательный подход к отбору журналов Плохая индексация
| Кохрановская библиотека
| Данные высококачественных исследований Международное сотрудничество Новейшая информация Хорошее структурирование информации Сокращает время поиска и оценки
| Проблемы доступа Некоторые тематические области представлены недостаточно
|
С точки зрения представления и обобщения данных существуют разные виды ресурсов (как первичных, так и вторичных): журналы, книги, отчеты, руководства, БД. Информацию о клинической эффективности сейчас можно найти во множестве журналов по медицине и здравоохранению — как национальных, так и международных.
Журналы вторичной информации
Существуют журналы, публикующие именно вторичную информацию — обзоры и резюме доказательных данных.
АСР Journal С1иb
URL: https://www.acpic.org/shared/menu_about.html
Основная цель службы American College of Physicians Journal Club состоит в том, чтобы выбирать из имеющейся биомедицинской литературы статьи с описаниями оригинальных исследований и систематические обзоры, которые необходимы для врачей, стремящихся использовать современные достижения медицины. Эти статьи обобщаются в виде рефератов и комментируются клиническими экспертами. Материалы для публикации тщательно отбирают из более чем 100 клинических журналов с использованием строгих критериев научного качества и с последующей оценкой пригодности для медицинской практики, выполняемой клиническими специалистами.
Evidence-Based Medicine
URL: https://www.ebm.bmjjournals.com/
Это совместное издание BMJ Publishing group and American Collage of Physicians выходит раз в два месяца и использует менее строгие критерии отбора, чем АСР Journal Club. ЕВМ публикует рефераты, представляющие особый интерес по терапии, хирургии, педиатрии, акушерству и гинекологии. Этот журнал имеет сильный европейский уклон. Бесплатный доступ для развивающихся стран.
Evidence-Based Mental Health
URL: https://www.ebmh.bmjjournals.com/
Цель издания состоит в том, чтобы информировать психиатров-клиницистов о важных и применимых в клинических условиях достижениях в области лечения (включая специфические вмешательства и системы обслуживания), диагностики, этиологии, прогнозирования и исследования результатов, улучшения качества, повышения квалификации и экономической оценки. Для этого сотрудники журнала отбирают оригинальные и обзорные статьи, результаты которых представляются наиболее точными и клинически полезными. Затем эти статьи обобщают в виде рефератов и дополняют комментариями экспертов-клиницистов. Бесплатный доступ для развивающихся стран.
Evidence-Based Nursing
URL: https://www.ebn.bmjjournals.com/
Ежеквартальный журнал, выпускаемый Королевским колледжем медсестринского дела и ВМJ Publishing. Чтобы помочь медсестрам, он находит и оценивает высококачественные и клинически важные исследования, публикуя сжатые информативные критические резюме таких статей с комментариями практикующих медсестер, способных определить место нового исследования в рамках данной области медицины. Бесплатный доступ для развивающихся стран.
Международный журнал медицинской практики (на русском языке)
URL: https://www.mediasphera.ru/mjmp/mjmp-mn.htm#
Журнал публикует структурированные рефераты ключевых, важных для практикующих врачей клинических и эпидемиологических исследований с комментариями, клинические рекомендации, статьи по методологии проведения клинических и аналитических исследований, биомедицинской статистике. На сайте представлены полные тексты всех статей. Издание возобновлено.
ВМJ Updates
URL: https://bmjupdates.mcmaster.ca/index.asp?choice=13
Этот бесплатный сервис — совместный проект ВМJ Publishing Group и Университета МакМастер (Канада). Есть возможность подписаться на рассылку (по электронной почте) информации о новых лучших доказательных публикациях по интересующей клинической специальности. Служба также включает доступ к БД резюме таких статей с 2002 года. Вазы данных первичной информации
MEDLINE
URL: https://www.pubmed.com
БД Национальной медицинской библиотеки США, содержащая библиографические описания статей и их рефераты (70 % статей имеют рефераты). В настоящее время БД охватывает почти 4500 журналов, издаваемых в США и более чем в 70 других странах. MEDLINE включает описания 12 млн. статей, опубликованных с 1966 года по настоящее время. Новые записи добавляются еженедельно, 400 000 записей в год. Для каждой записи в MEDLINE задаются медицинские предметные рубрики и типы публикаций из словаря, контролируемого Национальной медицинской библиотекой США. Библиографические описания и рефераты образуют основу и доступны в составе БД Национальной медицинской библиотеки США PubMed, в которой можно проводить поиск через Интернет. МЕDLINE содержит более 13 миллионов записей. Хотя сама БД не включает полных текстов статей, но их можно найти по ссылке на другом сайте (где они представлены бесплатно или платно).
перейти в каталог файлов
| Образовательный портал
Как узнать результаты егэ
Стихи про летний лагерь
3агадки для детей |